Wewnętrznymi komórkami organizacyjnymi Biura Architektury i Planowania Przestrzennego są:

• Wydział Administracji Architektoniczno-Budowlanej 
• Wydział Estetyki Przestrzeni Publicznej 
• Wydział Planowania Miejscowego 
• Wydział Polityki Przestrzennej 
• Wydział Polityki Rozwoju Infrastruktury Technicznej Miasta  
• Wydział Realizacji Urbanistycznej 
• Zespół ds. organizacji i finansów 
• Zespół radców prawnych  

Zobacz też:

• Zarządzenie nr 2119/2008 Prezydenta m.st. Warszawy z dnia 30 września 2008 r. w sprawie nadania wewnętrznego regulaminu działalności Biura Architektury i Planowania Przestrzennego 
• Zarządzenie nr 3147/2009 Prezydenta m.st. Warszawy z dnia 2 czerwca 2009 r. zmieniające zarządzenie w sprawie nadania wewnętrznego regulaminu działalności Biura Architektury i Planowania Przestrzennego
• Schemat struktury organizacyjnej Biura Architektury i Planowania Przestrzennego 
  
• Wydziały architektury i budownictwa dla dzielnic